夫妻分居后可以通过以下两种方式离婚：
一、协议离婚。如果夫妻双方都同意离婚，并且就财产分割、子女抚养等问题协商一致了，可以到民政局办理离婚登记办理协议离婚。
二、诉讼离婚。如果无法办理协议离婚的，可以由一方到提起离婚诉讼办理诉讼离婚。
【法律依据】
《民法典》第一千零七十九条，夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民提起离婚诉讼。
人民审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。