三证合一的实施对企业的员工管理确实会产生一定影响，具体表现在以下几个方面：
人事管理：三证合一将营业执照、组织机构代码证和税务登记证整合为一张证照，简化了企业的登记手续，减少了企业在注册、备案等方面的时间和精力成本。对于企业来说，这意味着人事管理部门在处理员工入职手续时更加便捷，也减少了相关的繁琐程序，提高了工作效率。
社会保障缴纳：三证合一后，企业的社会保险和公积金缴纳也会发生变化。原先需要分别使用不同的理相关手续，现在只需要一张三证合一的证照，简化了缴纳程序。企业在进行社会保障和公积金缴纳时需要留意相关变化，以确保员工的权益不受影响。
税收管理：税务登记证在三证合一后会被整合到一张证照中，企业需要及时了解相关税收的变化，确保按时缴纳税款。此外，企业还需注意新的税收对员工的个人所得税等方面是否有影响，及时调整工资结构和个税扣缴方式。
总体来说，三证合一对企业的员工管理带来了便利和简化流程的效果，但同时也需要企业及时了解变化，调整管理方式，以确保员工权益不受影响，同时提高管理效率。