在三证合一后，企业需要办理税务登记手续包括一般纳税人登记、企业所得税纳税人资格认定、个人所得税扣缴义务登记、印花税纳税人资格认定等。具体流程如下：
一般纳税人登记：企业需要向当地税务局提交一般纳税人登记申请，并提供相关材料，如营业执照、组织机构代码证、法定代表人身份证等。税务局会审核材料，并在符合条件的情况下核准登记。
企业所得税纳税人资格认定：企业需要向税务局提交企业所得税纳税人资格认定申请，并提供相关材料，如营业执照、财务报表、纳税人识别号等。税务局会审核企业的纳税资质，确定其是否符合企业所得税纳税人资格。
个人所得税扣缴义务登记：企业需要向税务局提交个人所得税扣缴义务登记申请，并提供相关材料，如员工身份证、工资薪金支付明细等。税务局会核准企业的个人所得税扣缴义务登记，并指导企业如何进行个人所得税的扣缴和申报。
印花税纳税人资格认定：企业需要向税务局提交印花税纳税人资格认定申请，并提供相关材料，如合同、协议等。税务局会审核企业的印花税纳税人资格，并核准登记。
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